8.2 Flagueo interactivo

Para algunos datos no es tan directo determinar los comandos de flagueo que pueden ser localizados en una plantilla. En tal caso, uno puede usar los CASA GUIs de plotms o viewer/msview de manera interactiva para flaguear datos directamente en el MS. Volver a ejecutar el pipeline es posible (usando el archivo casa_pipescript.py), pero se requiere atención en varios pasos:

For some data it is not straightforward to derive flagging commands that can be placed in a template. In that case, one may use the interactive plotms or viewer/msview CASA GUIs to flag data directly in the MS. Re-execution of the pipeline (via the casa_pipescript.py file) will be possible, but a few steps require attention:

• Ya que es muy probable que se haya ejecutado el Hanning smoothing en la primera ejecución, uno debe apagar el Hanning smoothing para todas las corridas. De otra manera se degrada la resolució de frecuencia cada vez más y los flageos se extenderan a los canales adyacentes por el suavizado de los MS flagueados previamente. Para hacer esto, cometar hifv_hanning en el archivo 'casa_pipescript.py' (ver la sección "Spectral Line" para un ejemplo similar).
• Por defecto, el pipeline revertirá todos los flagueos al estado original que fueron guardados en el archivo 'mySDM.ms.flagversions'. Entonces ignorará todas las modificaciones que fueron hechas. Para evitar que se reinice el flagueo, uno debe flaguear manualmente el MS y colocarlo en un nuevo directorio. No copie el direcotrio 'mySDM.ms.flagversions'. Ahora corra el pipeline con el MS flagueado como entrada hifv_importdata  a través del archivo modificado 'casa_pipescript.py' (es posible ejecutar tambien hifv.hifv(['MeasurementSet']) pero recuerde que esto repetirá el Hanning smoothing). Con este procedimiento el pipeline no podrá recuperar los flagueos originales y procederá con el flagueo manual, interactivo que el usuario aplicó directamente al MS.